Η μέθοδος της μαγνητικής διέγερσης στηρίζεται στην παραγωγή ενός ισχυρού παλμικού μαγνητικού πεδίου ισχύος ανάλογης μαγνητικού τομογράφου. Το παλμικό μαγνητικό πεδίο μαγνητικής επαγωγής  διεισδύει σε όλο το βάθος των ιστών και διεγείρει το σύνολο των δομών.